在试用期，员工提出离职申请，公司不同意是违法的。根据规定，试用期的劳动者只需提前三天通知单位，就能解除劳动合同，公司不能阻拦。要是公司扣工资、拖延支付，或者设置法律障碍，员工可以直接向当地劳动监察部门申诉或申请劳动仲裁。