处理劳动者与用人机构纠纷时，首先双方应协商。若协商不成，可向企业内部调解委员会或相关调解组织申请调解。若调解无效，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服，可向法院提起诉讼。